暑假里，三個小學生——珂蘭、郭囡囡和羅茜茜，結伴去羅江區圖書館借“金田一探案小說”，但她們發現這些書已經丟失，而介紹她們去借書的“咖啡貓”聽到后，卻表現出幸災樂禍的樣子，這讓她們很奇怪。隨著，她們驚訝地發現了一連串的圖書丟失案。她們決定偵破這個案件。在偵破案件過程中，發生了一系列怪異事件：她們接到了一張神秘的字條；破解字條上的秘密后，發現一個叫“A級收藏家”的可疑人；光天化日下，新買的圖書也丟失了；在古舊書攤調查時，遭遇到跟蹤；在一個雷雨夜里竟然接到了恐嚇電話……就在案子越來越復雜時，圖書館又發生了鎮館之寶手抄本《冤獄緣》被挪動事件。季館長請她們幫助破案。她們最終能破案嗎？故事的最后結局又是怎樣的呢？