一場可怕的霍亂使生活優越、相貌難看、脾氣暴躁的瑪麗成了一名孤兒,她被送到了英國的舅舅家。舅舅有一個莊園,莊園里有一個秘密花園。但花園沒有門,鑰匙也被埋了起來。瑪麗對此非常好奇,決心解開花園的秘密。在知更鳥的幫助下,瑪麗成功地進入了花園。花園的美麗讓她下定決心打理花園,使它恢復生機,充滿愛心的小男孩狄肯也前來幫忙,那個夜晚哭泣的少爺柯林也加入了他們。常去秘密花園并接觸大自然,瑪麗變得健康又開朗,人也變漂亮了。與此同時,柯林的病也好了,舅舅也變得樂觀起來。